Павлодар, Астана, Алматы имеют в своих автопарках трехдверные автобусы. Почему Караганда все время берет двухдверки имея такие же пассажиропотоки?

Да, вот только ни в Павлодаре, ни в Экибастузе третью дверь сейчас не открывают.
Валидаторы сразу устанавливают на перегородке водителя, соответственно вход в переднюю дверь, для выхода открывают вторую. Так что третья дверь и не будет использоваться большинстве случаев.